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罗氏GS FLX+系统成功完成西班牙耐药菌基因组测定

核心提示:某西班牙医院近期发生Klebsiella pneunomiae细菌的暴发事件,研究人员分离了三个具有耐药性的Klebsiella pneunomiae菌株,并利用罗氏454 GS FLX+系统获得了其基因组序列,这些数据补充了该细菌属的少量已知基因组信息,为其相关的耐药性研究、基因组进化研究提供了新的依据,同时为该细菌在此次医院内爆发事件提供新线索。

中国生物产业网www.cnbioindustry.cn】2012年3月29日讯  某西班牙医院近期发生Klebsiella pneunomiae细菌的暴发事件,研究人员分离了三个具有耐药性的Klebsiella pneunomiae菌株,并利用罗氏454 GS  FLX+系统获得了其基因组序列,这些数据补充了该细菌属的少量已知基因组信息,为其相关的耐药性研究、基因组进化研究提供了新的依据,同时为该细菌在此次医院内爆发事件提供新线索。

  Klebsiella pneunomiae常见于人类口腔以及胃肠道内,大多数情况下并不会引发疾病。但是其基因的某些突变会引起多种类型的感染,同时这一细菌也被发现具有很强的获得耐药性突变的能力。该西班牙医院的微生物部门获得的三个Klebsiella pneunomiae菌株在GS FLX+平台上完成测序后用仪器自带的GS De Novo拼接软件进行基因组拼接,并进行基因功能注释,结果发现这些细菌出现了很多耐药性方面的基因组进化,使得医院内常用的许多抗生素对其失效。

  通过这几个菌株基因组的比较研究,为Klebsiella pneumoniae细菌的抗药性研究提供了大量信息,也为在全球范围内减少抗药性细菌出现的努力提供帮助。通过与其他细菌基因组的比较,可以进一步了解微生物如何从对人类无害变成具有致病威胁的菌株。

  现在的微生物医学研究正随着测序技术的不断更新发展向新的方向,快速定性、定量研究微生物是目前的一大趋势,而454的GS FLX+以及为微生物检测、基因组测序拼接、比较基因组研究提供了强大的支持。

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  编辑:sunny

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