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华大基因测序全面揭示乙肝病毒整合机制

核心提示:2012年5月28日,由香港大学、新加坡国立大学、深圳华大基因研究院、亚洲癌症研究组织ACRG(由礼来公司、默克公司和辉瑞公司创建)共同完成的乙型肝炎病毒(简称乙肝病毒,HBV)整合机制研究成果。(Genome-wide Survey of Recurrent HBV Integration in Hepatocellular Carcinoma)

【中国生物产业网(http://www.cnbioindustry.cn)】5月28日讯

2012年5月28日,由香港大学、新加坡国立大学、深圳华大基因研究院、亚洲癌症研究组织ACRG(由礼来公司、默克公司和辉瑞公司创建)共同完成的乙型肝炎病毒(简称乙肝病毒,HBV)整合机制研究成果。(Genome-wide Survey of Recurrent HBV Integration in Hepatocellular Carcinoma)

该研究从全基因组水平上首次构建了一个高精度无偏差的乙肝病毒整合(HBV Integration)图谱,揭示了潜在的乙肝病毒整合机制,为肝癌的早期诊断、治疗及靶向药物研发等提供了非常宝贵的资源。

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)(以下简称为肝癌)是目前常见的恶性肿瘤之一,全世界每年约有100万人死于肝癌。我国肝癌发病率居世界之首,且肝癌死亡率很高,已成为我国第2大癌症杀手。乙肝病毒的基因可以整合入肝细胞基因组中,故称之为乙肝病毒整合。目前,乙肝病毒整合被认为在肝癌发生过程中具有重要作用。许多研究人员已在此方面展开大量的研究,但由于技术和临床样本数量的限制,严重阻碍了相关研究的进一步开展。

在本研究中,科研人员分别对来自81例HBV阳性患者和7例HBV阴性患者的癌组织样本和癌旁组织样本进行了全基因组测序及分析。结果发现HBV整合在肝癌中是一种普遍现象,HBV整合频率在癌组织中(86.4%)明显高于癌旁组织(30.7%)。结合转录组测序数据分析后,研究人员发现了3个新的HBV整合位点(CCNE1, SENP5, ROCK1),并推测这些基因可能在癌症的发生过程中起着非常重要的作用。

基于本研究成果,研究人员对潜在的HBV整合规律及其致癌机制进行了推测。他们发现HBV整合所具有的某些特征有助于病毒控制被感染的宿主基因,如HBV整合位点的偏向性以及HBV整合位点拷贝数目变异(CNV)增加等,这些变化将会影响染色体的稳定性及引起基因表达的改变。此外,研究还发现HBV整合与患者的临床表现密切相关。发生HBV整合的患者会更早地发展成为肝细胞癌而且治愈率更低。因此,通过对HBV整合的干预治疗可能有助于防止癌症的恶化,延长病人的生命。

这项成果于国际权威杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表。

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编辑:sunny

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